Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC22O60826 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms