Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDB2O43679 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDB2O43679 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDB2O43679 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDB2O43679 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDB2O43679 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDB2O43679 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDB2O43679 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDB2O43679 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDB2O43679 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDB2O43679 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDB2O43679 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms