Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms