Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGFO15240 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
VGFO15240 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VGFO15240 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGFO15240 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGFO15240 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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