Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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