Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNPHO15079 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNPHO15079 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNPHO15079 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNPHO15079 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms