Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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