Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

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Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGRNO00468 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AGRNO00468 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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