Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms