Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1431.7 ms