Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NIN4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NIN4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NIN4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NIN4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NIN4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms