Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms