Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L9A6NEM1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L9A6NEM1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L9A6NEM1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L9A6NEM1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L9A6NEM1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L9A6NEM1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms