Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms