Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMX2A2RU54 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms