Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms