Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y657

SPIN1, Spindlin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN1Q9Y657 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPIN1Q9Y657 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPIN1Q9Y657 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN1Q9Y657 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms