Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TUBE1Q9UJT0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TUBE1Q9UJT0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBE1Q9UJT0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms