Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL13Q9P2N7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms