Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC39A1Q9NY26 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A1Q9NY26 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A1Q9NY26 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms