Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKS1Q9NXB0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKS1Q9NXB0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms