Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CIPCQ9C0C6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIPCQ9C0C6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms