Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TP53INP1Q96A56 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53INP1Q96A56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53INP1Q96A56 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms