Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC71Q8IV32 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC71Q8IV32 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms