Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20,75■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20,69■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Ssuh2Q8C3L1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Ssuh2Q8C3L1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms