Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC149Q6ZUS6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC149Q6ZUS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms