Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNK6

TIFAB, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein B, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFABQ6ZNK6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFABQ6ZNK6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFABQ6ZNK6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TIFABQ6ZNK6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms