Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIGD3Q6B0B8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIGD3Q6B0B8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIGD3Q6B0B8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms