Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNTA1Q13424 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNTA1Q13424 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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