Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN1Q12860 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN1Q12860 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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