Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 TDP1YBR223C 1635 nt7.16□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 SGV1YPR161C 1974 nt7.15□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 YJL144WYJL144W 315 nt7.15□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 snR82snR82 268 nt7.14□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 CYC8YBR112C 2901 nt7.14□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 POP1YNL221C 2628 nt7.14□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 LAG2YOL025W 1983 nt7.13□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 DOC1YGL240W 753 nt7.13□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 CPR2YHR057C 618 nt7.13□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 YOR111WYOR111W 699 nt7.13□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 EFT2YDR385W 2529 nt7.13□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 EFT1YOR133W 2529 nt7.13□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 YHC3YJL059W 1227 nt7.12□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 AIM33YML087C 939 nt7.12□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 PHO85YPL031C 918 nt7.12□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 ACS1YAL054C 2142 nt7.12□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 CDC7YDL017W 1524 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 PTH2YBL057C 627 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 AAD14YNL331C 1131 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 GEF1YJR040W 2340 nt7.1□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 HAL5YJL165C 2568 nt7.1□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 MHP1YJL042W 4197 nt7.1□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 RDR1YOR380W 1641 nt7.09□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 PPH22YDL188C 1134 nt7.09□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 DYS1YHR068W 1164 nt7.09□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 SRY1YKL218C 981 nt7.09□□□□□ -1.27
SEC39Q12745 DAL4YIR028W 1908 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 YGR127WYGR127W 939 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 OPI1YHL020C 1215 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 CIS3YJL158C 684 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 MSI1YBR195C 1269 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 CIR2YOR356W 1896 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 ARG81YML099C 2643 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 COG1YGL223C 1254 nt7.07□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 STS1YIR011C 960 nt7.07□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 YPR127WYPR127W 1038 nt7.07□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 RBS1YDL189W 1374 nt7.07□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 MIX17YMR002W 471 nt7.06□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 SLA2YNL243W 2907 nt7.06□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 NCA3YJL116C 1014 nt7.05□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 IMA5YJL216C 1746 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 YGL081WYGL081W 963 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 YOL099CYOL099C 492 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 PEX31YGR004W 1389 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 HXK2YGL253W 1461 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 KEL1YHR158C 3495 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 RGD1YBR260C 2001 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 CSC1YLR241W 2349 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 AIM46YHR199C 933 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 FAF1YIL019W 1041 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 PEX13YLR191W 1161 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 MCP1YOR228C 909 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 ERV2YPR037C 591 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 ATG22YCL038C 1587 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 RGD2YFL047W 2145 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 PGI1YBR196C 1665 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC39Q12745 RSA4YCR072C 1548 nt7.02□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 BRN1YBL097W 2265 nt7.02□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 PPM1YDR435C 987 nt7.02□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 SPG1YGR236C 288 nt7.02□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.02□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 CST26YBR042C 1194 nt7.02□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 DLD1YDL174C 1764 nt7.02□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 BDS1YOL164W 1941 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 THI4YGR144W 981 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 POR2YIL114C 846 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 YJR142WYJR142W 1029 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 IDP3YNL009W 1263 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 PUS4YNL292W 1212 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 HDA1YNL021W 2121 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 YEN1YER041W 2280 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 FRE5YOR384W 2085 nt7□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 VHT1YGR065C 1782 nt7□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 YPR204WYPR204W 3099 nt7□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 KTR5YNL029C 1569 nt7□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 PRS4YBL068W 981 nt7□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 ADH5YBR145W 1056 nt7□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 NAF1YNL124W 1479 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 TPO3YPR156C 1869 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 NMA2YGR010W 1188 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 ICS3YJL077C 396 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 CUE4YML101C 354 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 YMR074CYMR074C 438 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 YPQ1YOL092W 927 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 GPA1YHR005C 1419 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 STE3YKL178C 1413 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 UME1YPL139C 1383 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 YPL067CYPL067C 597 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 TRR2YHR106W 1029 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 YML6YML025C 861 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 SPE3YPR069C 882 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 TUF1YOR187W 1314 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 SES1YDR023W 1389 nt6.96□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 PLB3YOL011W 2061 nt6.96□□□□□ -1.29
SEC39Q12745 GET2YER083C 858 nt6.96□□□□□ -1.3
SEC39Q12745 YJR107WYJR107W 987 nt6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms