Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt8.14□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 ENP1YBR247C 1452 nt8.13□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 TIF2YJL138C 1188 nt8.13□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 TIF1YKR059W 1188 nt8.13□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 HTZ1YOL012C 405 nt8.13□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 GDA1YEL042W 1557 nt8.13□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 RBS1YDL189W 1374 nt8.12□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 MRS3YJL133W 945 nt8.12□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt8.11□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 SPE4YLR146C 903 nt8.11□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 TAF11YML015C 1041 nt8.11□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 BRN1YBL097W 2265 nt8.11□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 PLB3YOL011W 2061 nt8.1□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 CDC10YCR002C 969 nt8.1□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 PUS4YNL292W 1212 nt8.1□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 YNR005CYNR005C 405 nt8.1□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 COA2YPL189C-A 207 nt8.1□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 CAN1YEL063C 1773 nt8.1□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 PRC1YMR297W 1599 nt8.09□□□□□ -1.11
SSF2Q12153 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt8.08□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 ERG10YPL028W 1197 nt8.08□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 PRE2YPR103W 864 nt8.08□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 YPR150WYPR150W 522 nt8.08□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 POX1YGL205W 2247 nt8.08□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 BIO3YNR058W 1443 nt8.08□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 YJL163CYJL163C 1668 nt8.08□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 BEM1YBR200W 1656 nt8.08□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 CCR4YAL021C 2514 nt8.07□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 LDB7YBL006C 543 nt8.07□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 FLC2YAL053W 2352 nt8.07□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 NUP57YGR119C 1626 nt8.07□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 THR1YHR025W 1074 nt8.06□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 SUN4YNL066W 1263 nt8.06□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 YOL046CYOL046C 675 nt8.06□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 YOL099CYOL099C 492 nt8.06□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 YPR076WYPR076W 375 nt8.06□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 APE4YHR113W 1473 nt8.06□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 MPH3YJR160C 1809 nt8.06□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 MHP1YJL042W 4197 nt8.05□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 RRP1YDR087C 837 nt8.05□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 AIM34YMR003W 597 nt8.05□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 EXG2YDR261C 1689 nt8.05□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 UTP6YDR449C 1323 nt8.04□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 FCY2YER056C 1602 nt8.04□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 ERP5YHR110W 639 nt8.04□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 NTG2YOL043C 1143 nt8.04□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 RSM23YGL129C 1353 nt8.04□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 RMD8YFR048W 1989 nt8.03□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 YJL107CYJL107C 1164 nt8.03□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 FIT2YOR382W 462 nt8.03□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 PHO85YPL031C 918 nt8.03□□□□□ -1.12
SSF2Q12153 ICE2YIL090W 1476 nt8.02□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 ARO10YDR380W 1908 nt8.02□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 CDS1YBR029C 1374 nt8.02□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 TRP1YDR007W 675 nt8.02□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 YAL045CYAL045C 309 nt8.02□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 YPR127WYPR127W 1038 nt8.02□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 CYS4YGR155W 1524 nt8.02□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 HEL1YKR017C 1656 nt8.02□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 APM4YOL062C 1476 nt8.01□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 HPT1YDR399W 666 nt8.01□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 CTA1YDR256C 1548 nt8.01□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 CMK2YOL016C 1344 nt8.01□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 AGX1YFL030W 1158 nt8□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 ITR1YDR497C 1755 nt7.99□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 CHA1YCL064C 1083 nt7.99□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 YKR018CYKR018C 2178 nt7.99□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 YOR111WYOR111W 699 nt7.99□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 PPH21YDL134C 1110 nt7.98□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 HOC1YJR075W 1191 nt7.98□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 HST2YPL015C 1074 nt7.98□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 COX15YER141W 1461 nt7.98□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 TFC6YDR362C 2019 nt7.98□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 OPT1YJL212C 2400 nt7.98□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 ASN2YGR124W 1719 nt7.98□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 LIA1YJR070C 978 nt7.97□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 PRB1YEL060C 1908 nt7.97□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 DLD1YDL174C 1764 nt7.97□□□□□ -1.13
SSF2Q12153 YNR048WYNR048W 1182 nt7.96□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 NAT5YOR253W 531 nt7.96□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YOS9YDR057W 1629 nt7.96□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 DRS1YLL008W 2259 nt7.95□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 IRC5YFR038W 2562 nt7.95□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 ENB1YOL158C 1821 nt7.95□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 GPD1YDL022W 1176 nt7.95□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YGL102CYGL102C 429 nt7.95□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 LOT6YLR011W 576 nt7.95□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 LPD1YFL018C 1500 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 FCY22YER060W-A 1593 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YIP4YGL198W 708 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YLL056CYLL056C 897 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 MIX17YMR002W 471 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 MRPL19YNL185C 477 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YBL081WYBL081W 1107 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 ASR1YPR093C 867 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 CHS5YLR330W 2016 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 RGT2YDL138W 2292 nt7.94□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 SEC24YIL109C 2781 nt7.93□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YIL092WYIL092W 1902 nt7.93□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 SSC1YJR045C 1965 nt7.93□□□□□ -1.14
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