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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
MSS1
YMR023C
1581 nt
6.59
□□□□□ -1.35
REX3
Q12090
TPO1
YLL028W
1761 nt
6.59
□□□□□ -1.35
REX3
Q12090
HXT17
YNR072W
1695 nt
6.58
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
MPE1
YKL059C
1326 nt
6.58
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
PET117
YER058W
324 nt
6.57
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
YJL144W
YJL144W
315 nt
6.56
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
MBF1
YOR298C-A
456 nt
6.56
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
TFB4
YPR056W
1017 nt
6.55
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
SLX5
YDL013W
1860 nt
6.55
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
MET13
YGL125W
1803 nt
6.55
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
YLR162W
YLR162W
357 nt
6.54
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
GET4
YOR164C
939 nt
6.54
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
DFR1
YOR236W
636 nt
6.54
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
PLB3
YOL011W
2061 nt
6.53
□□□□□ -1.36
REX3
Q12090
SGF73
YGL066W
1974 nt
6.52
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
YDL023C
YDL023C
321 nt
6.52
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
COG1
YGL223C
1254 nt
6.52
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
TPK1
YJL164C
1194 nt
6.52
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
VPS65
YLR322W
315 nt
6.52
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
DPM1
YPR183W
804 nt
6.52
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
PMT1
YDL095W
2454 nt
6.52
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
VMA2
YBR127C
1554 nt
6.52
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
TPI1
YDR050C
747 nt
6.51
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
EMP65
YER140W
1671 nt
6.5
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
HIS7
YBR248C
1659 nt
6.5
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
SUF3
tG(CCC)D
72 nt
6.5
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
SML1
YML058W
315 nt
6.5
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
ZIM17
YNL310C
525 nt
6.5
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
YOR111W
YOR111W
699 nt
6.5
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
snR30
snR30
606 nt
6.5
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
RPL43A
YPR043W
279 nt
6.49
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
YPR130C
YPR130C
408 nt
6.49
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
DEF1
YKL054C
2217 nt
6.49
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
BNA3
YJL060W
1335 nt
6.49
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
DCR2
YLR361C
1737 nt
6.48
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
YPR076W
YPR076W
375 nt
6.48
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
RUP1
YOR138C
2016 nt
6.48
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
NAF1
YNL124W
1479 nt
6.47
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
PDC5
YLR134W
1692 nt
6.47
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
CIA1
YDR267C
993 nt
6.47
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
RTC4
YNL254C
1206 nt
6.47
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
PUS4
YNL292W
1212 nt
6.47
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
YBR284W
YBR284W
2394 nt
6.47
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
SRP101
YDR292C
1866 nt
6.47
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
CYS4
YGR155W
1524 nt
6.46
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
BRN1
YBL097W
2265 nt
6.46
□□□□□ -1.37
REX3
Q12090
AFG3
YER017C
2286 nt
6.46
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
SKY1
YMR216C
2229 nt
6.45
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YMR027W
YMR027W
1413 nt
6.45
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YDR401W
YDR401W
564 nt
6.45
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
HTZ1
YOL012C
405 nt
6.45
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
ERG10
YPL028W
1197 nt
6.45
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
TKL2
YBR117C
2046 nt
6.45
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
KDX1
YKL161C
1302 nt
6.45
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
PLB2
YMR006C
2121 nt
6.44
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
PDA1
YER178W
1263 nt
6.44
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YGR068W-A
YGR068W-A
96 nt
6.44
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YIR020W-A
YIR020W-A
243 nt
6.44
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
MEU1
YLR017W
1014 nt
6.44
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
RDL2
YOR286W
450 nt
6.44
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
ASN1
YPR145W
1719 nt
6.44
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
CHL4
YDR254W
1377 nt
6.44
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YER137C
YER137C
447 nt
6.43
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
GNA1
YFL017C
480 nt
6.43
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
HNM1
YGL077C
1692 nt
6.42
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YJL163C
YJL163C
1668 nt
6.42
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
BIO3
YNR058W
1443 nt
6.42
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
GPD1
YDL022W
1176 nt
6.42
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
HOC1
YJR075W
1191 nt
6.42
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YLR030W
YLR030W
792 nt
6.42
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
LDB7
YBL006C
543 nt
6.42
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YCL049C
YCL049C
939 nt
6.42
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
TRP5
YGL026C
2124 nt
6.41
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
LIA1
YJR070C
978 nt
6.41
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YMR074C
YMR074C
438 nt
6.41
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YNR005C
YNR005C
405 nt
6.41
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
IMA2
YOL157C
1770 nt
6.41
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
HXK2
YGL253W
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6.41
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
GTS1
YGL181W
1191 nt
6.4
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
SNA3
YJL151C
402 nt
6.4
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
YOL046C
YOL046C
675 nt
6.4
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
RPO26
YPR187W
468 nt
6.4
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
MPH3
YJR160C
1809 nt
6.4
□□□□□ -1.38
REX3
Q12090
HXT2
YMR011W
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6.39
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
TCB1
YOR086C
3561 nt
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REX3
Q12090
YBL113C
YBL113C
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REX3
Q12090
PPH21
YDL134C
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□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
SRY1
YKL218C
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REX3
Q12090
FIT2
YOR382W
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REX3
Q12090
COX15
YER141W
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6.39
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
NOG2
YNR053C
1461 nt
6.39
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
CDC7
YDL017W
1524 nt
6.39
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
FCY22
YER060W-A
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6.39
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
MRPL35
YDR322W
1104 nt
6.38
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
YKL147C
YKL147C
618 nt
6.38
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
YOL099C
YOL099C
492 nt
6.38
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
IVY1
YDR229W
1362 nt
6.37
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
MSS51
YLR203C
1311 nt
6.37
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
AGX1
YFL030W
1158 nt
6.37
□□□□□ -1.39
REX3
Q12090
MRPL19
YNL185C
477 nt
6.37
□□□□□ -1.39
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