Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELAQ04206 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELAQ04206 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELAQ04206 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELAQ04206 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELAQ04206 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELAQ04206 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELAQ04206 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELAQ04206 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELAQ04206 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELAQ04206 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELAQ04206 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELAQ04206 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELAQ04206 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELAQ04206 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RELAQ04206 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RELAQ04206 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RELAQ04206 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RELAQ04206 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RELAQ04206 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RELAQ04206 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RELAQ04206 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RELAQ04206 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RELAQ04206 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RELAQ04206 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RELAQ04206 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELAQ04206 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELAQ04206 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELAQ04206 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELAQ04206 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELAQ04206 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELAQ04206 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELAQ04206 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RELAQ04206 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RELAQ04206 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RELAQ04206 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RELAQ04206 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RELAQ04206 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RELAQ04206 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RELAQ04206 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RELAQ04206 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RELAQ04206 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RELAQ04206 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RELAQ04206 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RELAQ04206 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RELAQ04206 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RELAQ04206 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELAQ04206 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELAQ04206 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELAQ04206 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RELAQ04206 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELAQ04206 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELAQ04206 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELAQ04206 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELAQ04206 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELAQ04206 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RELAQ04206 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RELAQ04206 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RELAQ04206 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RELAQ04206 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RELAQ04206 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RELAQ04206 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RELAQ04206 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RELAQ04206 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RELAQ04206 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RELAQ04206 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RELAQ04206 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RELAQ04206 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RELAQ04206 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RELAQ04206 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RELAQ04206 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RELAQ04206 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RELAQ04206 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RELAQ04206 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RELAQ04206 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RELAQ04206 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RELAQ04206 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RELAQ04206 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RELAQ04206 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RELAQ04206 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RELAQ04206 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RELAQ04206 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RELAQ04206 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELAQ04206 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RELAQ04206 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELAQ04206 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RELAQ04206 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELAQ04206 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELAQ04206 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELAQ04206 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RELAQ04206 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RELAQ04206 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RELAQ04206 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RELAQ04206 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RELAQ04206 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RELAQ04206 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RELAQ04206 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RELAQ04206 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RELAQ04206 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RELAQ04206 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms