Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 YMR074CYMR074C 438 nt7.6□□□□□ -1.19
CEF1Q03654 ZIM17YNL310C 525 nt7.6□□□□□ -1.19
CEF1Q03654 VBA5YKR105C 1749 nt7.6□□□□□ -1.19
CEF1Q03654 DML1YMR211W 1428 nt7.6□□□□□ -1.19
CEF1Q03654 YDR327WYDR327W 327 nt7.59□□□□□ -1.19
CEF1Q03654 FRE5YOR384W 2085 nt7.59□□□□□ -1.19
CEF1Q03654 PRC1YMR297W 1599 nt7.59□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 NPL6YMR091C 1308 nt7.58□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 DMC1YER179W 1005 nt7.58□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 TRR2YHR106W 1029 nt7.58□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 YJL144WYJL144W 315 nt7.58□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 MCP1YOR228C 909 nt7.58□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 MHP1YJL042W 4197 nt7.57□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 PET117YER058W 324 nt7.57□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 URA1YKL216W 945 nt7.57□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 DPM1YPR183W 804 nt7.57□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 YCL049CYCL049C 939 nt7.57□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 MSS51YLR203C 1311 nt7.56□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 MAL31YBR298C 1845 nt7.56□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 EEB1YPL095C 1371 nt7.56□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 PAP2YOL115W 1755 nt7.56□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 CDC23YHR166C 1881 nt7.55□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 CDC11YJR076C 1248 nt7.55□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 YLR122CYLR122C 378 nt7.55□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 SML1YML058W 315 nt7.55□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 IME2YJL106W 1938 nt7.54□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 PGI1YBR196C 1665 nt7.54□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 FLC2YAL053W 2352 nt7.54□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 GTS1YGL181W 1191 nt7.54□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 ERG27YLR100W 1044 nt7.54□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 LIP5YOR196C 1245 nt7.54□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 TUB1YML085C 1344 nt7.53□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 ARA2YMR041C 1008 nt7.53□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 AAD14YNL331C 1131 nt7.53□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 YPR130CYPR130C 408 nt7.53□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 CDC7YDL017W 1524 nt7.52□□□□□ -1.2
CEF1Q03654 JIP4YDR475C 2631 nt7.52□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.52□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 QCR6YFR033C 444 nt7.52□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 PUS4YNL292W 1212 nt7.52□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 YPL264CYPL264C 1062 nt7.52□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 MPE1YKL059C 1326 nt7.52□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 PLB2YMR006C 2121 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 MSN2YMR037C 2115 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 GYP8YFL027C 1494 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 APE4YHR113W 1473 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 AIM46YHR199C 933 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 SWP1YMR149W 861 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 GET4YOR164C 939 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 ERG10YPL028W 1197 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 AQR1YNL065W 1761 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 ERR3YMR323W 1314 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 ERR1YOR393W 1314 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 ERR2YPL281C 1314 nt7.51□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 REG2YBR050C 1017 nt7.5□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 GUF1YLR289W 1938 nt7.49□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 YLR162WYLR162W 357 nt7.49□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 YMR253CYMR253C 1245 nt7.48□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 HTZ1YOL012C 405 nt7.48□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 PHO85YPL031C 918 nt7.48□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 LGE1YPL055C 999 nt7.48□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 MPH3YJR160C 1809 nt7.48□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 RPL43AYPR043W 279 nt7.47□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 SEC24YIL109C 2781 nt7.47□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 DRS1YLL008W 2259 nt7.47□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 NUP84YDL116W 2181 nt7.46□□□□□ -1.21
CEF1Q03654 CIA1YDR267C 993 nt7.46□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 HMS2YJR147W 1077 nt7.46□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 ERG12YMR208W 1332 nt7.46□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YKR018CYKR018C 2178 nt7.46□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 ENB1YOL158C 1821 nt7.45□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 BRN1YBL097W 2265 nt7.45□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YJL163CYJL163C 1668 nt7.45□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 SUN4YNL066W 1263 nt7.45□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 LAG2YOL025W 1983 nt7.45□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 PRB1YEL060C 1908 nt7.44□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YDL023CYDL023C 321 nt7.44□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YHR145CYHR145C 357 nt7.44□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt7.44□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 FIT2YOR382W 462 nt7.44□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 NMT1YLR195C 1368 nt7.44□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 COX15YER141W 1461 nt7.43□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YAL045CYAL045C 309 nt7.43□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YBL070CYBL070C 321 nt7.43□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YOL046CYOL046C 675 nt7.43□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 SPE3YPR069C 882 nt7.43□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 BIO3YNR058W 1443 nt7.43□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 FCY2YER056C 1602 nt7.42□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 RSC2YLR357W 2670 nt7.42□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 CAN1YEL063C 1773 nt7.42□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 REV7YIL139C 738 nt7.42□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 PZF1YPR186C 1290 nt7.42□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 ATG23YLR431C 1362 nt7.42□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 IES1YFL013C 2079 nt7.42□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 NUP57YGR119C 1626 nt7.41□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YCR049CYCR049C 447 nt7.41□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 TOM20YGR082W 552 nt7.41□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YNR005CYNR005C 405 nt7.41□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 NTG2YOL043C 1143 nt7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 149.7 ms