Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP4Q02446 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP4Q02446 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP4Q02446 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP4Q02446 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP4Q02446 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SP4Q02446 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SP4Q02446 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SP4Q02446 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP4Q02446 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP4Q02446 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP4Q02446 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP4Q02446 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP4Q02446 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP4Q02446 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP4Q02446 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP4Q02446 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SP4Q02446 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SP4Q02446 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SP4Q02446 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SP4Q02446 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP4Q02446 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP4Q02446 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP4Q02446 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SP4Q02446 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SP4Q02446 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SP4Q02446 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SP4Q02446 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SP4Q02446 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SP4Q02446 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SP4Q02446 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SP4Q02446 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SP4Q02446 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SP4Q02446 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SP4Q02446 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SP4Q02446 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SP4Q02446 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SP4Q02446 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SP4Q02446 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SP4Q02446 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP4Q02446 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP4Q02446 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP4Q02446 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP4Q02446 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP4Q02446 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SP4Q02446 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP4Q02446 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SP4Q02446 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SP4Q02446 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SP4Q02446 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP4Q02446 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP4Q02446 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SP4Q02446 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP4Q02446 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP4Q02446 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SP4Q02446 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SP4Q02446 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SP4Q02446 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SP4Q02446 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SP4Q02446 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP4Q02446 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP4Q02446 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP4Q02446 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP4Q02446 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP4Q02446 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP4Q02446 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP4Q02446 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP4Q02446 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SP4Q02446 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SP4Q02446 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SP4Q02446 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SP4Q02446 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP4Q02446 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP4Q02446 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP4Q02446 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP4Q02446 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SP4Q02446 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SP4Q02446 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SP4Q02446 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SP4Q02446 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SP4Q02446 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SP4Q02446 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SP4Q02446 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SP4Q02446 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SP4Q02446 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SP4Q02446 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SP4Q02446 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SP4Q02446 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SP4Q02446 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SP4Q02446 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms