Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEMIN4P57678 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GEMIN4P57678 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEMIN4P57678 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms