Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX8P57073 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX8P57073 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX8P57073 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX8P57073 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX8P57073 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX8P57073 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX8P57073 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX8P57073 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX8P57073 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX8P57073 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX8P57073 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX8P57073 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX8P57073 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX8P57073 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX8P57073 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX8P57073 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX8P57073 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX8P57073 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX8P57073 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX8P57073 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX8P57073 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX8P57073 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX8P57073 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX8P57073 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX8P57073 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX8P57073 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX8P57073 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX8P57073 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX8P57073 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX8P57073 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX8P57073 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX8P57073 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX8P57073 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX8P57073 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX8P57073 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX8P57073 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX8P57073 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX8P57073 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX8P57073 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX8P57073 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX8P57073 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX8P57073 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX8P57073 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX8P57073 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX8P57073 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX8P57073 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX8P57073 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX8P57073 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX8P57073 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX8P57073 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX8P57073 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX8P57073 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX8P57073 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX8P57073 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX8P57073 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX8P57073 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX8P57073 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX8P57073 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX8P57073 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX8P57073 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX8P57073 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX8P57073 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX8P57073 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX8P57073 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX8P57073 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX8P57073 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX8P57073 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX8P57073 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX8P57073 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX8P57073 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX8P57073 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX8P57073 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX8P57073 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX8P57073 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX8P57073 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX8P57073 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX8P57073 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX8P57073 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX8P57073 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX8P57073 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX8P57073 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX8P57073 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX8P57073 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX8P57073 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX8P57073 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX8P57073 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX8P57073 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX8P57073 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX8P57073 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX8P57073 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX8P57073 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX8P57073 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX8P57073 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX8P57073 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX8P57073 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX8P57073 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX8P57073 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX8P57073 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX8P57073 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms