Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSR1P43307 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSR1P43307 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSR1P43307 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSR1P43307 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSR1P43307 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSR1P43307 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSR1P43307 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSR1P43307 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSR1P43307 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SSR1P43307 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSR1P43307 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSR1P43307 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSR1P43307 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSR1P43307 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSR1P43307 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSR1P43307 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSR1P43307 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSR1P43307 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSR1P43307 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SSR1P43307 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSR1P43307 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSR1P43307 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSR1P43307 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSR1P43307 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSR1P43307 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSR1P43307 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSR1P43307 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSR1P43307 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSR1P43307 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSR1P43307 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSR1P43307 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SSR1P43307 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSR1P43307 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSR1P43307 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSR1P43307 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSR1P43307 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSR1P43307 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSR1P43307 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSR1P43307 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSR1P43307 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSR1P43307 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSR1P43307 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSR1P43307 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSR1P43307 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSR1P43307 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSR1P43307 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSR1P43307 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSR1P43307 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSR1P43307 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSR1P43307 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSR1P43307 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSR1P43307 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSR1P43307 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSR1P43307 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SSR1P43307 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSR1P43307 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSR1P43307 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSR1P43307 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSR1P43307 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSR1P43307 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSR1P43307 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSR1P43307 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSR1P43307 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSR1P43307 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSR1P43307 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSR1P43307 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSR1P43307 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSR1P43307 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSR1P43307 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SSR1P43307 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSR1P43307 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SSR1P43307 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SSR1P43307 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSR1P43307 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSR1P43307 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSR1P43307 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms