Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YJL144WYJL144W 315 nt6.42□□□□□ -1.38
DDI1P40087 CUE4YML101C 354 nt6.42□□□□□ -1.38
DDI1P40087 KNS1YLL019C 2214 nt6.42□□□□□ -1.38
DDI1P40087 PHO3YBR092C 1404 nt6.42□□□□□ -1.38
DDI1P40087 YCR049CYCR049C 447 nt6.41□□□□□ -1.38
DDI1P40087 DAL7YIR031C 1665 nt6.41□□□□□ -1.38
DDI1P40087 EFT2YDR385W 2529 nt6.41□□□□□ -1.38
DDI1P40087 EFT1YOR133W 2529 nt6.41□□□□□ -1.38
DDI1P40087 PAB1YER165W 1734 nt6.4□□□□□ -1.38
DDI1P40087 UBP13YBL067C 2244 nt6.4□□□□□ -1.38
DDI1P40087 DMC1YER179W 1005 nt6.4□□□□□ -1.38
DDI1P40087 ADA2YDR448W 1305 nt6.4□□□□□ -1.39
DDI1P40087 CIR2YOR356W 1896 nt6.4□□□□□ -1.39
DDI1P40087 POP1YNL221C 2628 nt6.4□□□□□ -1.39
DDI1P40087 YEN1YER041W 2280 nt6.39□□□□□ -1.39
DDI1P40087 BIM1YER016W 1035 nt6.39□□□□□ -1.39
DDI1P40087 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.39□□□□□ -1.39
DDI1P40087 DYS1YHR068W 1164 nt6.39□□□□□ -1.39
DDI1P40087 GCN3YKR026C 918 nt6.39□□□□□ -1.39
DDI1P40087 ADH5YBR145W 1056 nt6.39□□□□□ -1.39
DDI1P40087 PEX31YGR004W 1389 nt6.39□□□□□ -1.39
DDI1P40087 YGL081WYGL081W 963 nt6.38□□□□□ -1.39
DDI1P40087 BUD20YLR074C 501 nt6.38□□□□□ -1.39
DDI1P40087 LAG2YOL025W 1983 nt6.38□□□□□ -1.39
DDI1P40087 RAP1YNL216W 2484 nt6.38□□□□□ -1.39
DDI1P40087 YIL055CYIL055C 1884 nt6.37□□□□□ -1.39
DDI1P40087 ISC1YER019W 1434 nt6.37□□□□□ -1.39
DDI1P40087 ACS1YAL054C 2142 nt6.37□□□□□ -1.39
DDI1P40087 ELP4YPL101W 1371 nt6.36□□□□□ -1.39
DDI1P40087 BRN1YBL097W 2265 nt6.36□□□□□ -1.39
DDI1P40087 YJR107WYJR107W 987 nt6.36□□□□□ -1.39
DDI1P40087 SLA2YNL243W 2907 nt6.36□□□□□ -1.39
DDI1P40087 snR82snR82 268 nt6.35□□□□□ -1.39
DDI1P40087 NMA2YGR010W 1188 nt6.35□□□□□ -1.39
DDI1P40087 YGR127WYGR127W 939 nt6.35□□□□□ -1.39
DDI1P40087 AIM33YML087C 939 nt6.35□□□□□ -1.39
DDI1P40087 MSI1YBR195C 1269 nt6.35□□□□□ -1.39
DDI1P40087 RIO1YOR119C 1455 nt6.34□□□□□ -1.39
DDI1P40087 ATP23YNR020C 813 nt6.34□□□□□ -1.39
DDI1P40087 HXK2YGL253W 1461 nt6.34□□□□□ -1.4
DDI1P40087 URH1YDR400W 1023 nt6.33□□□□□ -1.4
DDI1P40087 HIS1YER055C 894 nt6.33□□□□□ -1.4
DDI1P40087 TAD2YJL035C 753 nt6.33□□□□□ -1.4
DDI1P40087 YUR1YJL139C 1287 nt6.33□□□□□ -1.4
DDI1P40087 NUP53YMR153W 1428 nt6.33□□□□□ -1.4
DDI1P40087 YKR032WYKR032W 315 nt6.32□□□□□ -1.4
DDI1P40087 YML122CYML122C 381 nt6.32□□□□□ -1.4
DDI1P40087 MPE1YKL059C 1326 nt6.31□□□□□ -1.4
DDI1P40087 YDL177CYDL177C 513 nt6.31□□□□□ -1.4
DDI1P40087 YDR415CYDR415C 1125 nt6.31□□□□□ -1.4
DDI1P40087 TRS31YDR472W 852 nt6.31□□□□□ -1.4
DDI1P40087 THI4YGR144W 981 nt6.31□□□□□ -1.4
DDI1P40087 RTC4YNL254C 1206 nt6.31□□□□□ -1.4
DDI1P40087 TUB1YML085C 1344 nt6.3□□□□□ -1.4
DDI1P40087 NAF1YNL124W 1479 nt6.3□□□□□ -1.4
DDI1P40087 TOS6YNL300W 309 nt6.3□□□□□ -1.4
DDI1P40087 ATG22YCL038C 1587 nt6.3□□□□□ -1.4
DDI1P40087 SLX5YDL013W 1860 nt6.3□□□□□ -1.4
DDI1P40087 SES1YDR023W 1389 nt6.3□□□□□ -1.4
DDI1P40087 YPQ2YDR352W 954 nt6.29□□□□□ -1.4
DDI1P40087 NCA3YJL116C 1014 nt6.29□□□□□ -1.4
DDI1P40087 YKR023WYKR023W 1593 nt6.29□□□□□ -1.4
DDI1P40087 GDH1YOR375C 1365 nt6.29□□□□□ -1.4
DDI1P40087 NFS1YCL017C 1494 nt6.28□□□□□ -1.4
DDI1P40087 YMR034CYMR034C 1305 nt6.28□□□□□ -1.4
DDI1P40087 YDR476CYDR476C 675 nt6.28□□□□□ -1.4
DDI1P40087 MET8YBR213W 825 nt6.28□□□□□ -1.4
DDI1P40087 CSC1YLR241W 2349 nt6.28□□□□□ -1.4
DDI1P40087 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.27□□□□□ -1.41
DDI1P40087 CBR1YIL043C 855 nt6.27□□□□□ -1.41
DDI1P40087 YOR343CYOR343C 327 nt6.27□□□□□ -1.41
DDI1P40087 PAU21YOR394W 495 nt6.27□□□□□ -1.41
DDI1P40087 PAU22YPL282C 495 nt6.27□□□□□ -1.41
DDI1P40087 GEF1YJR040W 2340 nt6.26□□□□□ -1.41
DDI1P40087 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.26□□□□□ -1.41
DDI1P40087 IRC11YOR013W 471 nt6.26□□□□□ -1.41
DDI1P40087 YPT1YFL038C 621 nt6.25□□□□□ -1.41
DDI1P40087 COX5AYNL052W 462 nt6.25□□□□□ -1.41
DDI1P40087 VHT1YGR065C 1782 nt6.25□□□□□ -1.41
DDI1P40087 RGD1YBR260C 2001 nt6.25□□□□□ -1.41
DDI1P40087 HAL5YJL165C 2568 nt6.24□□□□□ -1.41
DDI1P40087 PET494YNR045W 1470 nt6.24□□□□□ -1.41
DDI1P40087 MRP1YDR347W 966 nt6.24□□□□□ -1.41
DDI1P40087 PTC7YHR076W 1032 nt6.24□□□□□ -1.41
DDI1P40087 RPL31BYLR406C 342 nt6.24□□□□□ -1.41
DDI1P40087 KTR5YNL029C 1569 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.8 ms