Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCER1AP12319 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCER1AP12319 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms