Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

Predictions only

Length 4,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC2O95714 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC2O95714 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC2O95714 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC2O95714 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC2O95714 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC2O95714 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC2O95714 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC2O95714 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC2O95714 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC2O95714 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC2O95714 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC2O95714 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC2O95714 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC2O95714 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC2O95714 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC2O95714 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC2O95714 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC2O95714 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC2O95714 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC2O95714 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC2O95714 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC2O95714 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC2O95714 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC2O95714 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC2O95714 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC2O95714 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC2O95714 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC2O95714 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC2O95714 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC2O95714 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC2O95714 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC2O95714 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC2O95714 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC2O95714 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC2O95714 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC2O95714 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC2O95714 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC2O95714 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC2O95714 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC2O95714 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2O95714 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2O95714 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2O95714 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2O95714 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2O95714 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2O95714 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2O95714 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2O95714 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2O95714 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2O95714 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2O95714 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2O95714 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2O95714 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2O95714 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2O95714 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2O95714 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2O95714 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2O95714 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2O95714 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2O95714 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2O95714 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2O95714 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2O95714 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC2O95714 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC2O95714 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC2O95714 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HERC2O95714 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC2O95714 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC2O95714 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC2O95714 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC2O95714 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC2O95714 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC2O95714 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC2O95714 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC2O95714 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC2O95714 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC2O95714 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC2O95714 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC2O95714 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC2O95714 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC2O95714 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC2O95714 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC2O95714 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC2O95714 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC2O95714 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC2O95714 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms