Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF14O43557 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF14O43557 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF14O43557 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms