Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ApobE9Q414 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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