Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VGLL3A8MV65 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VGLL3A8MV65 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VGLL3A8MV65 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms