Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC61Q9Y6R9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms