Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG4BQ9Y4P1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms