Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR3KQ9Y2Y1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR3KQ9Y2Y1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms