Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms