Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms